視頻編碼是高清網絡攝像機的一項關鍵參數，它決定了所傳輸視頻的圖像質量以及需要的網絡帶寬。我們目前看到的高清網絡攝像機視頻編碼標準主要有MJPEG和H.264兩種。
MJPEG(MotionJPEG)是在JPEG基礎發展起來的動態圖像壓縮技術，它只單獨的對某一幀進行壓縮，而基本不考慮視頻流中不同幀之間的變化。通過此壓縮技術可獲取清晰度很高的視頻圖像，而且可靈活設置每路的視頻清晰度和壓縮幀數，并且壓縮后的畫面還可任意剪接。但它的缺陷也非常明顯：丟幀現象嚴重、實時性差，在保證每路都必須是高清晰的前提下，很難完成實時壓縮;壓縮效率低，傳輸帶寬和存儲空間占用大。
H.264是ITU-T和ISO共同成立的JVT聯合視頻工作組制定的新一代視頻編碼標準，用來實現視頻的高壓縮比、高圖像質量、良好的網絡適應性等目標。H.264不僅比MJPEG節約了80%以上的碼率，而且對網絡傳輸具有更好的支持功能。H.264引入了面向IP包的編碼機制，有利于網絡中的分組傳輸，支持網絡中視頻的流媒體傳輸，支持不同網絡資源下的分級編碼傳輸，從而獲得平穩的圖像質量。H.264可以在更低的帶寬下實現720p、1080i/p的廣播級高清視頻分辨率。
盡管MJPEG能夠獲得比較好的單幅圖像質量，但由于它在運動性、帶寬占用以及存儲空間占用方面均有致命缺陷，高清網絡攝像機未來必然以H.264為主。
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