關于活性炭吸附除去有機物的效果，附著微生物以后是不利的。從微生物的大小與起吸附作用的微孔的物理性大小完全不同方面來看，很難想象微生物本身會堵塞孔隙。但是可以認為，由于微生物的附著，其代謝產物及其他有機物蓄積在活性炭表面上，通過其數量會對活性炭的吸附量及吸附速度產生影響。此外，還如學者的報告中所指出的那樣，要處理的有機物質受到微生物分解及其他各種各樣的分解以后，結果親水性提高，不利于活性炭進行吸附。微生物附著在活性炭上所帶來的利弊，應從處理工藝的總體上進行評價。
在活性炭上附著的微生物的定量方面，研究過的有示差熱分析法、差分灰化法、多精類分析法以及基耶達分解法等。這些方法是基于測定活性炭與微生物的分解舉動的差異性觀點；或者是根據多糖類及氮是來自微生物的假定，以及基于用酸來分解活性炭活性炭以外的有機物的觀點進行測定的。生物膜是由各種微生物形成的生態體系，而且即使是同一種微生物，也存在代謝活性炭有差異的場合。必須留意的是，在微生物的數目或者重量以外，也存在著與微生物分解的除去量有關系的其他因素。
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