BioNumerics是能夠以生物學的各種試驗數據作為輸入數據,以強大的整合數據庫為中心,對生物學數據進行比較,分析,研究的系統。它有以下三個重要特征:
數據管理:提供對指紋圖譜、2D膠、基因序列、基因芯片、基因表型特征、矩陣、曲線和動力學描述等所有生物學數據存儲,提取,搜索功能,非常適合做生物實驗室數據管理的核心。
數據分析:通過對數據進行比較篩查,分析數據之間的不同點和相似性,從而將數據進行分類,定義,和統計學分析,并可用來鑒定未知的生物體。BioNumerics分析功能的獨特之處在于它可以綜合多次試驗或者不同實驗方法的結果,更加全面、快速的分析生物學數據。 (www.shanghaiep.com)
網絡共享:使用BioNumerics提供的網絡共享功能,在指定的網絡里,用戶之間可以方便地交換共享生物數據,并能導入互聯網上知名的專業數據庫。
BioNumerics很好的滿足了研究機構或診斷機構對不同的生物學數據進行分析的要求。這套軟件系統已經得到了很多研究機構,包括疾控中心,大學,醫院,公共醫療中心,食品,藥物和制藥企業等各種實驗室的廣泛認可。 (www.shanghaiep.com)
應用模塊:
Fingerprint Data 指紋類型數據: (www.shanghaiep.com)
對凝膠圖譜、自動測序儀數據、lab-on-a-chip系統的電泳指紋圖譜等進行標準化處理與分析,如應用于PFGE、MALDI、AFLP、RFLP、RAPD、REP-PCR、ARDRA、IEF、DGGE、TGGE等實驗數據分析。
Character Data 特征類型數據: (www.shanghaiep.com)
對來源于表型、抗生素耐藥譜、微陣列等的特征數據進行導入與分析。在多位點VNTR分析(MLVA)中,該模塊提供了自動化的分析流程。
Sequence Data 序列類型數據: (www.shanghaiep.com)
對Sanger序列和二代測序數據進行拼接與分析,提供序列分析、搜索和比對以及比較工具。該模塊常用于多位點序列分型(MLST)中。
Whole Genome Map Data 全基因組圖譜類型數據: (www.shanghaiep.com)
對菌株鑒定和分類進行全基因圖譜排列和快速可視化聚類。
Trend Data 趨勢類型數據: (www.shanghaiep.com)
處理實時熒光定量 PCR數據;代謝活性和酶活性的動力學數據;微陣列實驗中的時間進程數據等和趨勢相關的實驗數據。
分析模塊:(www.shanghaiep.com)
Tree and Network Inference 聚類分析與建樹: (www.shanghaiep.com)
從多種聚類運算方法中選擇合適方法計算進化樹和關系網。
Classifiers and Identification 分類與鑒定 (www.shanghaiep.com)
運用*先進的分類鑒定方法,如Naive Bayesian,SVM,Shrunken Centroids及類似 方法,對未知物種進行分類和鑒定。
商業插件:(www.shanghaiep.com)
Heteroduplex Analysis Plugin (www.shanghaiep.com)
BandScoring Plugin (www.shanghaiep.com)
SNP genotyping Plugin (www.shanghaiep.com)
Diversilab Plugin:與BioMerieux(梅里埃)公司DiversiLab基因分型系統進行數據共享并進一步分析
更多的信息請登錄BioNumerics中文專門網站:www.bionumerics.cn |
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