一、溫度對殺菌滅藻劑殺菌效力的影響，可通過幾種方式起作用：
①當溫度升高時，增加了微生物細胞原生質膜的通透性，甚至會對膜造成損傷，使殺菌滅藻劑更容易進入作用部位；
②溫度升高，殺菌滅藻劑的穿透能力增強，擴散速度加快，便于迅速通過障礙，到達作用部位；
③溫度升高有利于在作用點上的殺菌滅藻劑與菌體代謝中間產物之間的生物化學反應，加速了殺菌滅藻劑效力的發揮。
已經有實驗證明，苯酚對副傷寒桿菌的殺菌力，溫度每增加10℃，殺菌力增強2~3倍。
二、pH值對殺菌滅藻劑殺菌效力的影響：
①對微生物影響 外界pH值的改變，可使微生物細胞壁或原生質膜的結構發生變化，從而影響了膜的通透性，使殺菌滅藻劑更難或更易到達作用部位。
②對殺菌滅藻劑活性的影響 pH值對許多殺菌滅藻劑的抗菌性能影響很大：一些有機酸類防腐劑如苯甲酸、山梨酸、脫氫醋酸等是以分子形式其抑菌作用的，它們在pH≥7時會離解成負離子，失去抑菌活性，季銨鹽類殺菌滅藻劑，在堿性介質中有高的抑菌活性，而在pH值低時，抑菌活性很小；當pH值從5增到8時，布羅波爾的MIC值從6.25mg/kg增加到10~25mg/kg；卡松在pH＞8的情況下易分解失去活性。
三、濕度對殺菌滅藻劑殺菌效力的影響：
某些氣體殺菌滅藻劑的作用受環境相對濕度的影響，如環氧乙烷，相對溫度越高，殺菌效果越差。水分活度是表示保護對象中的水可被微生物利用的程度。每種材料均由一定的水分活度值，降低材料的水分活度值，對殺菌滅藻劑的效果是有益的，反之，若水分活度值很大，也可使殺菌滅藻劑喪失其應有的保護作用。
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