季節交替易引起水產品的病害，要做好水產品的病害防治工作，就要經常的對水體進行消毒滅菌處理，使用水產紫外線消毒器能夠有效的防止病害的發生。
養殖過程中，有兩類方法可以防止水產品的病害。一類是對水產品的本身消毒，這類需要到藥物，在防治進程中會根據不同種類的飼養選用不相同的用藥辦法,這幾種用藥辦法：一是運用藥浴的辦法，運用在轉池及運送前后的水產品身體消毒，在網箱養殖中也會采用此法。若在水產品種類放養前對身體進行藥浴，就可有用預防各種病害。第二是注射法，常用的注射法有腹腔注射和肌肉注射。注射法進入體內的藥量精確,吸收快、效果好,用藥量少,相對的比較費事。因此一般只在人工注射疫苗時選用;貴重種類有時也選用此法。第三種是內服法,將藥物或疫苗與水產動物喜吃的飼料混合,拌以黏合劑,制成顆粒藥飼投喂,消滅體內的病菌或增強抗病能力。這樣可以有效的防治水產品本身的病害。
另一類就是對整個水產品養殖水體的消毒，運用水產紫外線消毒器，將水體的病菌等有害物物質滅活，并降解水體中有害的有機物，保障整個水體的安全。從而達到防止水產品病害的目的。
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