光合菌在水產養殖中，能夠降解水體中的亞硝酸鹽、硫化物等有毒物質，菌種比較單一；em菌是由微生物活性菌、光合菌、反硝化菌、乳酸菌、放線菌、酵母菌等以及水域微生物和水體所有要的脫羧酶、氧化酶等微量生物元素復合而成，是綜合菌，包含了光合菌，不僅可以調節水質，控制物生物數量，肥水發酵餌料等多種功能作用。是生態水產養殖中不可缺少的產品。
調節水質的方法： 一般每月潑灑2到3次，稀釋倍數1:100，每畝地（水深一米）用量為1公斤。水質過于混濁時在水質太差時，每畝地（約1米深）可以一次倒入5公升水產EM菌液。
發酵魚飼料的方法：
發酵方法：
1.把要發酵的原料粉碎處理備用。準備好一公斤活化好的飼料發酵生物菌劑，然后準備少量的能量物質如玉米粉、小麥粉、麥麩等等。
2.然后把發酵液用少量清水稀釋，和能量物質即發酵輔料攪拌均勻，拌到能撒開的干濕度。
3.把拌好的發酵輔料和要發酵的糟渣類原料混合一起，量大可采用逐級混合的方式，混合均勻，拌到手握一把成坨，用力握不出水的感覺即可。
4.*后用塑料薄膜覆蓋好好，密封發酵5到7天即可。
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