食用油精煉設備所生產的油脂在光照，加熱以及添加劑的情況下可能會出現一些變異，導致順式脂肪酸變成了反式脂肪酸。
食用油精煉設備中產生的反式脂肪酸結構一般是線性結構，這種獨特的結構也會具備一些獨特的物理或者化學性質，譬如，熔點和沸點都比順式脂肪酸要高，而且熱穩定性也是比較好的。這也就說明，如果想除去食用油中的反式脂肪酸，就會破壞順式脂肪酸。那么食用油精煉設備生產的油脂中反式脂肪酸都有哪些來源呢?
(1)天然反式脂肪酸，有少量存在于反芻動物(牛、羊)脂肪、乳及乳制品中，其主要來源于飼料部分不飽和脂肪酸在反芻動物腸腔中丁酸弧菌屬菌群酶促生物氫化。
(2)油脂在食用油精煉設備中經過經氫化生成反式脂肪酸。部分氫化過程由于氫氣在催化劑作用下加成到甘油三酯不飽和雙鍵上，有些雙鍵會移位且發生順―反構型互變，即生成反式不飽和脂肪酸
(3)食用油精煉設備高溫精煉及高溫油炸時產生反式脂肪酸。在精煉油脂時，反式脂肪酸主要產生于脫臭工序。在油脂脫臭過程中，由于不飽和脂肪酸長時間在高溫環境中，使油脂中二烯酸酯、三烯酸酯發生熱聚合反應，更易發生異構化，使反式脂肪酸含量增加
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