甲基化檢測服務
實驗原理
DNA甲基化是最早發現的基因表觀修飾方式之一,真核生物中的甲基化僅發生于胞嘧啶,即在DNA甲基化轉移酶( DNMTS)的作用下使CpG二核苷酸5~端的胞喀啶轉變為5”-甲基胞喀啶。DNA甲基化通常抑制基因表達,去甲基化則誘導了基因的重新活化和表達。這種DNA修飾方式在不改變基因序列前提下實現對基因表達的調控。
注:M:甲基化引物PCR擴増;U:非甲基化引物PCR擴増。SW1353細胞在藥物處理后從完全甲基化轉變為完全非甲基化,OUMS-27細胞在5-Aza-dC處理后從部分甲基化部分非甲基化狀態轉變為完全非甲基化。
Northern或 Southern Blot檢測服務
實驗原理
Southern雜交是進行基因組DNA特定序列定位的方法,由 Southern于1975年創建,稱為 Southerne印跡技術。其原理為利用瓊脂糖凝膠電泳分離經限制性內切酶消化的DNA片段,將膠上的DNA變性并在原位將單鏈DNA片段轉移至尼龍膜或其他固相支持物上,經干烤或者紫外線照射固定,再與相對應結構的DG標記探針進行雜交,用放射自顯影或酶反應顯色,從而檢測特定DNA分子的含量。
Northerne印跡雜交( Northern blot)是一種將RNA從瓊脂糖凝膠中轉印到硝酸纖維素膜上的方法,主要利用堿基配對原則,利用特性的DNA探針與其雜交,經過顯影技術分析RNA的最和大小。RNA印跡技術正好與DNA相對應,故被稱為 Northern印跡雜交,與此原理相似的蛋白質印跡技術則被稱為 Western blot
實驗流程
a) Northern Blot
1.完整mRNA的分離
2.根據RNA的大小通過瓊脂糖凝膠電泳對RNA進行分離
3.將RNA轉移到固相支持物上,在轉移的過程中,要保持RNA在凝膠中的相對分布
4.將RNA固定到支持物上
5.固相RNA與探針分子雜交
6.除去非特異結合到固相支持物上的探針分子
7.對特異結合的探針分子的圖像進行檢測、捕獲和分析
b)Southern Blot
1、制備待測DNA2、DNA限制酶消化
3、瓊脂糖凝膠電泳分離待測DNA樣品
4、電泳凝膠預處理
5、轉膜
6、探針標記
7、預雜交
8、 Southern雜交
9、洗膜
10、放射性自顯影檢測
11、實驗結果分析及報告
樣本要求
1.新鮮組織:
用解剖刀等迅速切成小碎塊約30-100mg,放入20mL離心營中開蓋液氮速東15min.80度保存,干冰運輸。每個northern blot泳道提供2-3管樣品。注:解剖刀處理組織的時間盡量控制在1min以內。液氮速凍時必須開蓋以防炸裂。
2細胞樣品:
縣浮細胞1000-1500rpm,5min,常溫離心收集細胞。貼壁細胞用胰蛋白酶消化后吹丁收集,PBS洗滌細胞,去除多余培養基和胰蛋白酶。開蓋液氮速凍15min,-80度保存干冰運輸,一般情況下,細胞培養的6孔板每孔細 |
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