適宜的溫度是種子萌發的重要因素，因為溫度影響種子吸水，氣體交換和酶的活性，從而影響呼吸代謝和生長。影響芽苗菜種子萌發的溫度，可分為*低溫度，*適溫度和*高溫度。如大豆類種子*低溫度為6—8度，*適溫度為25—30度，*高溫度為39—40度。麥類;*低溫度為3—5度，*適溫度20—25度，*高溫度30—35度。種子對溫度的影響一般在生產過程中可以根據種子的特性來定，冬季的品種溫度低先，夏季的品種溫度高一先。
氧氣;
種子萌發是非常活躍的生命活動，需要呼吸作用不斷地供給能量和物質合成的原料。因此，氧氣成為種子萌發必不可少的條件，如果種子萌發期間供氧氣不足，則會導致無氧呼吸，一方面貯藏物質消耗過多過快，另一方面產生酒精引起中毒。
不同作物種子萌發時需氧量不同，一般作物種子需要空氣含氧量在10%以上才能正常萌發，含脂肪較多的種子(如大豆，花生，向日葵)比淀粉種子(如麥類，玉米)要求更多的氧氣若空氣含氧量下降至5%以下時，多數作物種子不能萌發，但也不些植物種子(如黃瓜)在含氧量降到2%時仍可萌發，而水稻種子對缺氧有特殊的適應本領，可在無氧條件下萌發，不過，缺氧時幼苗生長不正常，芽鞘迅速伸長，而根系生長受阻或不發根。
光
光對大多數植物種子的萌發沒有明顯影響，但有些植物如苜蓿，胡蘿卜等種子的萌發則需要光，稱為需光種子，相反，有些植物如茄子，番茄瓜類等種子的萌發在光下受抑制，稱為喜暗種子。但是，某些種子需光與嫌光并不*對，常常與環境條件變化和種子內部生理狀況有關。 |
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