近幾年的環保大力推行，使得的有機肥制作和使用越來越廣泛，很多秸稈或者是農作物剩料都在不能焚燒之后，轉化為了非常好的有機肥料使用。其實在不斷使用化肥的農戶，就早已經發現化肥對于土壤的傷害，想要長久的土地肥沃，還是使用有機質肥料更能有效長遠就行土壤改良，農業的發展轉向了綠色，有機的環境。
除了一些簡單就可以直接做肥料使用的農作物或者有機質，還有一些還比較難腐熟或者直接使用的有機廢料，是可以通過使用生物發酵劑來進行快遞腐熟發酵處理的，通過生物菌的催化作用，使得有機廢料更好的作為有機肥來進行使用，下面是有機廢料通過生物發酵劑做堆肥發酵的過程。
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堆肥的整個腐解過程，是一系列微生物活動的復雜過程，包括堆制材料的礦質化和腐殖化過程。堆腐初期以礦質化為主，后期則為腐殖化占優勢。這種過程的快慢和方向，受堆肥材料的組成和含有各種微生物及其環境條件所左右。因此，了解這些因子的變化規律及其相互關系，對于積制好堆肥具有重要意義。
從高溫堆肥的堆溫變化大體可以反映出微生物活動概況。
① 發熱階段 堆制初期，堆溫上升到50℃左右稱發熱階段。堆內溫度在25~40℃范圍內適合于一些無芽孢桿菌、球菌、芽孢桿菌、放線菌、真菌和硝酸細菌等中溫性的微生物活動，它們能先利用水溶性的有機物質而迅速繁殖，繼而分解蛋白質和部分的半纖維素和纖維素，同時釋放出NH3、CO2和熱量。
② 高溫階段 堆制2~3天后，堆溫升到50~60℃，稱為高溫階段。此時出現大量好熱性的微生物，如好熱真菌的一些類群，普通小單孢菌、好熱褐色放線菌和高溫纖維素分解菌等代替了原有的中溫性微生物。它們除對尚存的易分解有機物繼續分解外，主要是分解半纖維素、纖維素和部分木質素。與此同時進行腐殖化過程。本階段后期，有機物分解強度漸弱，高溫維持一定時期后開始下降。
③ 降溫階段 在高溫過后，堆溫逐漸下降到50℃以下，稱為降溫階段。此時，堆內微生物種類和數量較高溫階段多，例如有中溫性的纖維分解粘細菌、芽孢稈菌、真菌和放線菌等數量顯著增加。一些好熱性和耐熱性微生物種類，在降溫過程中仍然維持著活動。在這個階段里，堆內可分解的有機物料基質銳減，腐殖化作用占*對優勢。
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