以下內容來源：企無憂資助規劃平臺
申請高新技術企業其實是個比較復雜繁瑣的工作，需要多部門配合，準備的材料也比較多。尤其是一些財務賬目不是很清晰的企業，財務數據資料就得花很多時間區整理。而且財務方面的數據還得出具審計報告。因此財務方面的材料整理顯得尤為重要，影響高新技術企業認定是否能順利通過。下面企無憂給大家說說關于高新技術企業認定申報的幾個問題。
（一）關于申報主體問題
申請認定的企業必須是獨立的法人企業，與企業所得稅納稅申報的主體一致。母子公司應分別申報，母公司申報時只能包含母公司的情況，不能以合并報表的數據申報；實行總分機構匯總納稅的企業，只能以總機構申報，應包含分支機構所有情況。
（二）關于研發費用核算問題
《工作指引》中明確，企業的研究開發費用是以單個研發活動為基本單位分別進行測度并加總計算的。企業應設置高新技術企業認定專用研究開發費用輔助核算賬目，認真對每個研究開發項目進行費用或資產化登記，提供相關憑證及明細表，并按《工作指引》要求進行核算。申報企業應具有完善的財務內部控制制度，嚴格按照企業會計準則或相關財務會計制度的規定記載或披露財務會計信息。
企業的研發費用和生產經營成本應分開核算，不能混淆。研發費用不得從生產成本中剝離。
1、執行《企業會計制度》的企業，在“管理費用”科目下設“研發費用”二級科目，在該科目下按照研究開發項目和費用種類分別歸集核算。
2、執行《企業會計準則》或《小企業會計準則》的企業，設置“研發支出”一級科目，該科目核算企業進行研究與開發無形資產過程中發生的各項支出。該科目應按照研究開發項目，分別“費用化支出”與“資本化支出”進行明細核算。
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