西貝母堿
常用標簽包括有Flag、myc、HA、His、GST、GFP、MBP等。
Flag標簽系統利用一個短的親水性八氨基酸肽（DYKDDDDK）融合到目標蛋白；其純化條件是非變性的，因此可以純化所有有活性的融合蛋白。
His標簽是由6個組氨酸（His-His-His-His-His-His）組成的短肽，專門設計用于重組蛋白的吸附純化。由于分子量小，且較容易分離和純化，是目前使用最廣泛的一種。
GST標簽體系具有蛋白表達率高，表達產物純化方便，利于GST抗體制備的特點。GST融合蛋白在水溶液中可溶，可從細菌裂解液中提取，在不變性的條件下通過親和層析得到。
GFP或其突變體EGFP等廣泛用于基因表達效率的檢測，以及和目的蛋白融合表達用于檢測目的蛋白的表達和分別。GFP抗體不經可以檢測GFP或其適當的突變體，也可以檢測和GFP或其適當的突變體融合表達蛋白的表達、細胞內定位，以及純化、定性或定量檢測GFP融合表達蛋白等。
Myc標簽（序列為：EQKLISEEDL）已成功應用于WB雜交技術、免疫沉淀IP和流式細胞術中。因此可用于檢測重組蛋白在細菌、酵母、昆蟲細胞和哺乳細胞中的表達情況。Myc重組蛋白質可通過偶聯Myc標簽抗體到活化的瓊脂糖上而進行親和純化。但Myc重組蛋白的低pH洗脫條件往往會降低蛋白質的活力，因此Myc標簽系統廣泛應用于檢測但很少用于純化。
HA標簽系統利用一個HA（influenza hemagglutintin epitope:YPYDVPDYA）短肽融合到目標蛋白。HA標簽可位于蛋白質的C端或N端，該系統已廣泛應用于多種細胞類型，相應的HA標簽抗體也被廣泛運用。
MBP標簽蛋白大小為40kDa，由大腸桿菌K12的malE基因編碼。MBP可增加在細菌中過量表達的融合蛋白的溶解性，尤其是真核蛋白。如果蛋白在細菌中表達，MBP可以融合在蛋白的N端或C端�？捎肕BP抗體或表達的目的蛋白特異性抗體檢測MBP標簽標記的重組蛋白。
其余標簽抗體還有V5、GFP、RFP、β-Actin、β-Tubulin、GAPDH、ERK1、AU1、Avi、B、CBP、DDDDK、E、E2、Glu-Glu、HAT、HPC4、HSV、KT3、KLH、MAT、Protein A、S、S1、SNAP、SRT、NWSHPQFEK、SUMO、T7、Tag-100、TAP、Trx、Ty1、TF、Universal、VSV-G等，但應用相對較少。
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