資產評估的科學性與準確性，決定其能夠作為認定商業秘密損害賠償額的有效方式。但在司法審判與知識產權資產評估的結合過程中，明確評估標準、規范評估行為仍是需要探索和完善的內容。
權利人實際損失的計算：實踐中權利人主張實際損失，主要依據自身的研發成本、減少的訂單數量×平均利潤等。直接依據技術秘密研發成本主張實際損失，一般難以得到支持。權利人實際損失，實際上是指權利人預期收益數額，即若無被告的侵權行為，原告本可獲得的利潤。如原告無證據證明其因被告侵權行為而失去的訂單數量，一般可推定侵權行為人新增訂單源自權利人因侵權行為失去的訂單，權利人可依據侵權行為人訂單數量和行業平均利潤主張賠償額。如果證據確鑿可信，甚至可依據權利人的利潤率確定。但對權利人的舉證水平有較高要求，對于銷售數量、價格、利潤率等均須有比較明確、直接的證據。
侵權人侵權獲利的計算：從司法實踐看，證明實際損失難度較高，以侵權獲利來確定賠償數額相對容易，因侵權獲利證據相對而言較易獲得，如：侵權產品銷售量×行業平均利潤率。鑒于目前我國許多中小企業會計管理制度不完善，權利人要想獲取相關的財務數據，困難很大。證明侵權獲利還需要證明涉案商業秘密在企業經營獲利中貢獻率的相應證據。因侵權人的利潤有多種來源，一般難以認定侵權人經營所獲利潤都來源于爭議的商業秘密。
這種計算方式面臨的問題：一是能否獲取完整的侵權人會計管理數據，成為評估侵權人侵權獲利的關鍵；二是侵權人獲利來源與爭議的商業秘密是否有直接關系。
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